MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p1

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017032	T	6	6	1089	1094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017032	ATTTTA	2	12	1098	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017032	AAAT	2	8	1123	1130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017032	ACAATC	2	12	1171	1182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017032	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017032	T	6	6	1264	1269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017032	TAA	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017032	AG	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017032	CTT	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017032	TGC	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017032	T	6	6	1372	1377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017032	GTT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017032	TGA	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017032	A	8	8	1479	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017032	TCG	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017032	T	7	7	1636	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017032	T	6	6	1781	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017032	GTGG	2	8	1862	1869	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017032	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017032	GCTT	2	8	2248	2255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017032	CAA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017032	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017032	GTG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017032	ATA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017032	AGC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017032	TCT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017032	GGA	2	6	2576	2581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017032	TGC	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017032	CTA	2	6	2669	2674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017032	ATTT	2	8	2708	2715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017032	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017032	TAG	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017032	GGT	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017032	GGA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017032	ACG	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017032	AAT	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017032	GTA	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017032	ATTT	2	8	3550	3557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017032	AGG	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017032	T	6	6	3838	3843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017032	A	6	6	3852	3857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017032	TATGA	2	10	4122	4131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017032	ATG	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017032	AT	3	6	4225	4230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017032	TAA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017032	T	6	6	6156	6161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017032	AGG	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017032	GAG	2	6	6897	6902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017032	AGG	2	6	9653	9658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017032	GAA	2	6	10431	10436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017032	ATT	4	12	10456	10467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017032	TCTT	2	8	10471	10478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017032	TAT	2	6	10509	10514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017032	GCT	2	6	10577	10582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017032	ATT	2	6	10624	10629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017032	TAC	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017032	A	6	6	10679	10684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017032	A	7	7	12792	12798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017032	ATA	2	6	14926	14931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017032	A	6	6	14982	14987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017032	GCC	2	6	14988	14993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017032	T	6	6	15236	15241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017032	TAT	2	6	15245	15250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017032	T	6	6	15256	15261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017032	TAA	2	6	15263	15268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017032	TTG	2	6	15348	15353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017032	TAAAA	2	10	15376	15385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017032	AAG	2	6	15392	15397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017032	T	7	7	16464	16470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017032	GGA	2	6	25144	25149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017032	A	6	6	28390	28395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017032	AGG	2	6	30115	30120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017032	CTC	2	6	30318	30323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017032	T	7	7	30382	30388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017032	T	6	6	30445	30450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017032	TAGG	2	8	30527	30534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017032	A	6	6	30558	30563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017032	TAT	2	6	30616	30621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017032	AGG	2	6	31402	31407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017032	TAG	2	6	33019	33024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017032	T	7	7	33092	33098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017032	GTG	2	6	33128	33133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017032	AAAG	2	8	33157	33164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017032	GGA	2	6	33170	33175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017032	A	6	6	35771	35776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017032	T	6	6	35800	35805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017032	AGG	2	6	39733	39738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017032	CAA	2	6	41792	41797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017032	TAT	2	6	41863	41868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017032	TCTT	2	8	41893	41900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017032	CCT	2	6	41996	42001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017032	TAT	2	6	42041	42046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017032	AAG	2	6	42372	42377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017032	A	6	6	42476	42481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017032	TC	3	6	42486	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017032	ACCGCC	2	12	42498	42509	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017032	GAA	2	6	42516	42521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017032	GTTC	2	8	42604	42611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017032	CAA	2	6	42647	42652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017032	GC	3	6	42703	42708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017032	CCTTGT	2	12	42709	42720	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017032	ATTC	2	8	42733	42740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017032	CAA	2	6	42745	42750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017032	AAAG	2	8	42757	42764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017032	AGG	2	6	42797	42802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017032	AATC	2	8	42806	42813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017032	GAAA	2	8	42818	42825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017032	ATT	2	6	42830	42835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017032	ATT	2	6	42855	42860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017032	CAC	2	6	42875	42880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017032	A	6	6	42958	42963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017032	TTGA	2	8	42991	42998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017032	TG	3	6	44180	44185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017032	A	6	6	44196	44201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017032	CGC	2	6	44255	44260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017032	GGT	2	6	44264	44269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017032	AG	3	6	44301	44306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017032	AGG	2	6	44523	44528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017032	GGTG	2	8	44762	44769	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017032	TA	3	6	44866	44871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017032	TA	3	6	46503	46508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017032	A	6	6	46528	46533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017032	AAG	2	6	46560	46565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017032	AAG	2	6	46624	46629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017032	AAAT	2	8	46685	46692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017032	AAGGG	2	10	47239	47248	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017032	ATTT	2	8	47313	47320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017032	AT	3	6	47453	47458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017032	T	6	6	47483	47488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017032	ATAA	2	8	47553	47560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017032	T	7	7	47582	47588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017032	AGT	2	6	47620	47625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017032	AAT	2	6	47629	47634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017032	GTG	2	6	47641	47646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017032	GATT	2	8	47655	47662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017032	ATA	2	6	47691	47696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017032	A	6	6	47724	47729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017032	TA	3	6	47751	47756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017032	GGA	2	6	47777	47782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017032	TGT	2	6	50390	50395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017032	TA	3	6	50421	50426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017032	ATG	2	6	50438	50443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017032	CTTTT	2	10	50463	50472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017032	T	6	6	50485	50490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017032	TAAA	2	8	50492	50499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017032	TCAA	2	8	50502	50509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017032	AT	3	6	50538	50543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017032	TA	3	6	50560	50565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017032	TTA	2	6	50587	50592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017032	T	6	6	51059	51064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017032	T	6	6	52126	52131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017032	TGT	2	6	52162	52167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017032	T	6	6	54317	54322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017032	TAT	2	6	54369	54374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017032	AAT	2	6	54384	54389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_017032	AAT	2	6	54928	54933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017032	AT	4	8	54950	54957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_017032	A	7	7	56386	56392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_017032	GATA	2	8	56448	56455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.